文津阁是为了庋藏《四库全书》而建造的，阁楼内书籍繁多，是内廷四阁中第一座建成之阁。
藏书的去向
文津阁建成以后，1782年，《四库全书》成书，共誊写了7部，其中一部藏于文津阁。7部《四库全书》随着中国的命运沉浮，只有文津阁内的藏本保存完好。1915年，文津阁本《四库全书》由国民政府内务部运归北京，藏于古物保存所，后拨交新成立的京师图书馆（今国家图书馆的前身）保存，遂至于今天，成为国家图书馆的镇馆之宝。
据国家图书馆的有关史料记载，文津阁本《四库全书》，于1915年由内务部运抵北平，暂时藏于古物保存所；是年10月，经国民政府教育部根据前清奏案，咨行内务部，将其拨归京师图书馆。
次年夏天，复将原来的书架交来，计经、史、子、集四部：共103架，6144函，36300册。外有《分架图》4函，4册；殿本《四库全书提要》20函，124册。经史子集卷帙，以四种颜色将其分别开来。经部为绿色，史部为红色，子部为蓝色，集部为灰色。每册卷首盖有"文津阁宝"，末页盖有"避暑山庄"、"太上皇帝之宝"小篆朱文方印各一颗。史部的《八旗通志》成於嘉庆初年，后再补入，故里面仅有"嘉庆御览之宝"一方。全书与通行印本的《四库全书目录》微有不同，大概因为抄写较晚，所以有修订改易之处。
文献价值
20世纪前期，文津阁本就受到学者的重视。1920年，前辈知名学者陈垣就曾亲自对文津阁本进行清查，统计全部收书3462种，列有103架，6144函，36277册，2291100页。陈垣先生还细阅文津阁本所收书的提要，发现与《四库全书总目提要》有不少差异，因此与几位学者共同撰写《景印四库全书提要缘起》一文，建议将文津阁本的提要汇集影印出来。这可以说是提议影印文津阁本的首例，至今已有八十多年。
遗憾的是，文津阁本以善本贮存于图书馆，不对外开放，一般研究者无法借阅，因此长时期来对文津阁本，只能仰而慕之，不能阅而研之。好在于20世纪90年代初，国家图书馆研究员杨讷先生提议并主持了文渊阁《四库全书》影印本与文津阁《四库全书》原书核对录异的工作，核对从集部开始，后由北京图书馆出版社出版《文渊阁四库全书补遗（集部）》，共15册，二百余万字。
据该书统计，文渊阁本集部共收书1273种，其中与文津阁本有差异的有788种，而宋代诗文集，文渊阁本失收、可据文津阁补入的，有1160条，涉及118种书。后台湾研究宋史的学者黄宽重，曾据此《补遗》一书，撰写一文：《文津阁本宋代别集的价值及其相关问题》。黄氏仔细将《补遗》与影印文渊阁本核对，发现《补遗》也有疏忽，提出《补遗》所收的宋人诗文，实际上有些已收于文渊阁本，不过卷次不同，而为编者重复收录。
但他认为《补遗》所辑的大部分，确是文渊阁本所缺的，因此以为：“文津阁本宋代文集的部分，保留了不少各书作者个人生平事迹及诗文的评论资料，对研究各文集的作者提供了更为丰富的资讯；此外文中也保留许多对研究宋代史事有所助益的史料，显示文津阁本的史料价值。”
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